Kompleks Sendangduwur terdiri dari bangunan masjid makam dan gapura-gapura. Walaupun bangunan masjidnya sudah mengalami perubahan namun masih tetap berdiri pada fondasi aslinya. Berbagai ragam hias yang dipahatkan pada bangunan di kompleks Sendang duwur menunjukkan bahwa masyarakat disana pada waktu itu tidak mudah meninggalkan konsep lama yang pernah mereka anut.