Salah satu kajian penting pada saat kegiatan Coupling Processes Equatorial Atmospher (CPEA) Campaign 2004 di Kototabang yang berlangsung selama kurang lebih satu bulan pengamatan (10 April-10 Mei 2004) adalah analisis tentang struktur vertikal fenomena Madden Julian Oscillation (MJO) terkait dengan masalah aktivitas Super Cloud Clusters (SCCs) sebagai salah satu parameter utama dalam mengkaji perilaku curah hujan yang terjadi di kawasan barat Indonesia. Data utama yang digunakan adalah data Equtorial Atmosphere Radar (EAR) Boundary Layer Radar (BLR) Mini Automatic Weather Station (MAWS) dan Optical Rain Gauge (ORG) yang ada di SPD LAPAN Kototabang. Sementara data penunjang yang digunakan meliputi data anomali radiasi gelombang panjang (Outgoing Longwave Radiation OLR) dan data curah hujan permukaan. Berbasis hasil analisis menggunakan teknik spektral khususnya Fast Fourier Transform (FFT) terhadap data anomali rata-rata lima harian (pentad) OLR periode 2001-2005 menunjukkan bahwa osilasi dominan daripada data tersebut sekitar 30 harian. Osilasi ini umumnya terjadi dilapisan bawah troposfer dengan arah propagasi menuju ke arah timur. Selain itu diketemukan pula adanya proses konvergensi dan divergensi pada lapisan 3 dan 10 km diatas permukaan laut (dpl) khususnya pada tanggal 23 April 2004 hasil analisis data EAR. Akhirnya kami mencoba mengkaitkan kejadian ini dengan menganalisis keterkaitan antara OLR dengan curah hujan yang ada di Kototabang dan kawasan sekitarnya khususnya hasil pengukuran ORG dengan nilai koefisien korelasi sekitar 0 71.