Melastoma affine mampu tumbuh baik pada tanah asam dengan kelarutan Al yang tinggi. Salah satu protein yang penting dalam detoksifikasi cekaman xenobiotik termasuk cekaman asam dan Al adalah multidrug resistance associated protein (MRP) yang disandi oleh gen mrp. Penelitian ini bertujuan mengisolasi dan mengklon fragmen cDNA MaMrp yang menyandi MRP dari M. affine. cDNA total telah berhasil disintesis dari RNA total sebagai cetakan melalui transkripsi balik. Fragmen cDNA MaMrp telah berhasil diisolasi dengan PCR dengan menggunakan cDNA total sebagai cetakan dan primer mrp yang dirancang dari Arabidopsis thaliana ragi dan manusia. Fragmen ini telah berhasil disisipkan ke dalam plasmid pGEM-T Easy dan plasmid rekombinan ini telah berhasil diintroduksikan ke dalam Escherichia coli DH5 alpha . Analisis urutan nukleotida menunjukkan bahwa fragmen MaMrp berukuran 633 pb yang menyandi 208 asam amino. analisis kesejajaran lokal berdasarkan urutan nukleotida menunjukkan bahwa fragmen MaMrp memiliki kesamaan 69% dengan mRNA AtMrp1 dan 63% dengan mRNA AtMrp2 dari A. thaliana. Berdasarkan deduksi urutan asam amino MaMRP memiliki kesamaan 84%dengan AtMRP13 77% dengan AtMRP12 dan 73% dengan AtMRP1 dari A. thaliana. analisis kesejajaran dengan AtMRP1 menunjukkan bahwa fragmen MaMRP terletak di antara domain TM1 NBF1 dan mempunyai urutan asam amino yang spesifik QCKAQLQNMEEE.