Profil model mental siswa sangat diperlukan untuk mengetahui keberhasilan dan kesulitan siswa dalam mendeskripsikan representasi makroskopis submikroskopis simbolik sebagai ciri-ciri ilmu kimia. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis profil model mental siswa kelompok eksperimen dan kontrol serta mengetahui pengaruh media pembelajaran berbasis Macromedia Flash terhadap model mental siswa kelas X MIA. Tahun 2019/2020 di SMA Negeri 1 Pekanbaru pada pelajaran Bentuk Molekul. Itu adalah Metode Penelitian Campuran yang mengintegrasikan penelitian kualitatif dan kuantitatif dengan desain penjelasan. Sampel yang dipilih sebanyak 20 siswa dengan teknik Simple Random Sampling. Instrumen yang digunakan dalam penelitian ini adalah tes diagnostik two-tier dan wawancara untuk memperkuat data yang diperoleh. Hasil analisis data menunjukkan bahwa profil mental siswa kelompok eksperimen dengan media pembelajaran berbasis Macromedia Flash secara keseluruhan memiliki 70% model mental utuh dan 30% model mental alternatif siswa kelompok kontrol memiliki 37% model mental utuh dan 63% model mental alternatif. Hasil penelitian juga menunjukkan adanya pengaruh media pembelajaran berbasis Macromedia Flash terhadap model mental siswa. Hasil pengujian hipotesis dengan bantuan bantuan SPSS menunjukkan sig. (2-tailed) 0 000 artinya Ha diterima dan H0 ditolak.